MacとWindows、
UNIXでは改行コードがそれぞれ異なっています。

ですから、
Windowsに基本で付属しているメモ帳などのソフトでは、
Mac用の改行を認識することができません。

対処法としては、
WZ Editorや秀丸エディタといった「Mac用の改行コードも認識できるエディタ」を使われるか、
変換ツールを使われるかすればよいでしょう。

変換ツールの例を挙げておきますと、
改行コードの一括変換やCoDesk(Windows用)、ふみばこ(Mac用)などがあります。